| 指定 | 名称 | 所有寺院
| 国宝 | 宝簡集巻第四十 後醍醐天皇綸旨 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第四十 護良親王御願文 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第十四 光厳院々宣 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第二十四 金澤貞顕書状礼紙書 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第三 三善資連備後国太田庄山中郷寄進状 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第三 紀伊国凶徒対治事書 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第四十二 後醍醐天皇旨 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第四十二 不断愛染護摩並長日談義書 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第十三 足利尊氏御教書 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第四十 足利直義御教書 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第三十九 後醍醐天皇勅願文 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第三十九 長慶天皇願文 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第三十七 金剛峯寺衆徒契状 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第二十三 北畠親房蓮華乗院 勧学科所寄進状 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第一 鑁阿書状 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第二十一 光厳院々宣 | 金剛峯寺
| 国宝 | 宝簡集巻第二十一 後村上天皇綸 | 金剛峯寺
| 国宝 | 聾瞽指帰 下巻 | 金剛峯寺
| 重文 | 金剛峯寺御朱印縁起 | 金剛峯寺
| 未指定 | 大日如来金口所説一行法身即身成仏品経奥書 | 宝寿院
| 未指定 | 万里小路宣房書状 | 宝寿院
| 未指定 | 高野板版本 大日経疏 | 宝寿院
| 未指定 | 北条政子書状 | 金剛三昧院
| 重文 | 地蔵菩薩像 | 宝寿院
| 重文 | 弁財天図 | 宝寿院
| 重文 | 伝熊野曼荼羅図 | 龍泉院
| 重文 | 当麻曼荼羅縁起図 | 清浄心院
| 重文 | 一字金輪曼荼羅図 | 遍照光院
| 未指定 | 騎獅文殊曼荼羅図 | 桜池院
| 未指定 | 文殊菩薩像 | 清浄心院
| 未指定 | 文殊菩薩像 | 北室院
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